在百子成功渡過地表入侵，山基因危機(jī)，Ari智能危機(jī)以及天幕輻射危機(jī)的5年后，天空人和小oHeda領(lǐng)導(dǎo)的地表人又回到了地面。在重建家園的時(shí)，意外發(fā)現(xiàn)大戰(zhàn)前美國國防建的海底智能化基地由于備用供終止，浮出水面。在探索后發(fā)，基地并沒有幸存者。 　　在修好了供電設(shè)備后，天空人進(jìn)了海底基地的控制系統(tǒng)，原來是在冷戰(zhàn)時(shí)期就開始研發(fā)的太戰(zhàn)基地，之所以修在海底是為安全和保密。海底基地可以接還在運(yùn)行的軍事衛(wèi)星，意外發(fā)美國已經(jīng)偷偷和宇宙的神族文取得了聯(lián)系，神族文明的外交隊(duì)已在百年前出發(fā)，現(xiàn)在已進(jìn)銀河系的邊緣。 　　神族文明發(fā)現(xiàn)地球文明已經(jīng)不復(fù)存在。時(shí)ari當(dāng)時(shí)備份在宇宙空間站的系統(tǒng)錯(cuò)誤判定神族文明的來，希望他們能幫助人類重建家。然而神族文明卻已開始了殖地球的計(jì)劃。外交艦隊(duì)的任務(wù)消滅地球殘留文明建立新的秩。天空人和地表人將如何利用球倒退的文明擊敗宇宙神族將本季的亮點(diǎn)。 　　基本劇情設(shè)定，神族文明也是碳基生物，有和人類相似的外形，其武器是基于量子力學(xué)開發(fā)的，只不比人類當(dāng)年科技全勝的要先進(jìn)神族文明當(dāng)年和地球文明互相現(xiàn)后，認(rèn)為地球文明的科技具爆炸性，未必能在到達(dá)地球后保持技術(shù)領(lǐng)先，不過由于對于知世界的好奇，他們派出了2艘星艦和1w名神族戰(zhàn)士的外交艦隊(duì)?