位于東京西的巨大“學都市”。在人口達230萬人，其中8成是學生的這座都市中實施著超能開發(fā)的特殊程，學生們能力被給予“無能力Level 0”到“超能力Level 5”的六階段價。高中生條當麻，也住在學園都的學生之一他由于隱藏右手中的力——只要是能之力，就神的加護都消除的“幻殺手Imagine Breaker”，而被評價名落孫山的無能力”，著充滿不幸人生。而上的學生生活由于暑假開時從天而降純白修女而生了巨大的化。自從與離“魔法”界的她——禁書目錄茵克絲”相遇始，上條就卷入了各種樣的事件中統(tǒng)率學園都的“科學”、與茵蒂克關聯(lián)的“魔”方，在驚地解決雙方件的過程中他的人際關也逐步擴展之后，魔法方的十字教大宗派羅馬教，終于注到上條的存……。如同應魔法方一，科學方的園都市也有動作。但也與逐漸開始立的世界動抗爭的人不出現(xiàn)。那些過與上條有關聯(lián)，而使運大為改變“英雄”們他們挺身而與世界對峙如同上條當做過的那樣科學與魔法三次交織之，故事將大推進！?