將施奈德回老家之后，四天狗原本如兄弟的神龜由于沒(méi)有了敵人，是不再想以往一樣一起戰(zhàn)斗，而各自在喜歡的領(lǐng)域內(nèi)鉆研，以往起行動(dòng)的忍者神龜們變成雷祖四個(gè)來(lái)獨(dú)往的“獨(dú)行俠”！這時(shí)，紐市中發(fā)生一連竄的怪事。原來(lái)實(shí)家馬克西米林安?J?威特斯意圖征服紐約市，秘密培養(yǎng)了竦斯支遠(yuǎn)怪獸組成的軍隊(duì)，加上惡名昭彰忍者組織Foot Clan，各種黑暗勢(shì)力又在城市的角落里蠢欲動(dòng)！神龜們又處于備戰(zhàn)囂態(tài)了他們?cè)俅温?lián)合起來(lái)，準(zhǔn)備向黑暗力出擊！?豆?