正德十六年，武駕崩，朱厚熜即，建元嘉靖。李聞被封為太醫(yī)院目。 李言聞好友吳藥師因治錯(cuò)小主的病，被關(guān)入中。吳藥師臨終孤，將女兒吳斯許配給李時(shí)珍。 長(zhǎng)大后李時(shí)珍進(jìn)明書院學(xué)習(xí)，和王府世子朱成翊為同學(xué)。朱成翊望拉攏李時(shí)珍為己所用，卻被李珍嚴(yán)詞拒絕。朱翊遂與李時(shí)珍成死對(duì)頭。 李時(shí)珍偶遇一個(gè)美麗的女朱萇葶，卻發(fā)她脈象異常，命久已。李時(shí)珍給治療多年頑癥，人產(chǎn)生愛慕之情一次偶然的機(jī)會(huì)李時(shí)珍發(fā)現(xiàn)少女然是荊王府郡主 李時(shí)珍希望能考取功名，得個(gè)一半職，與萇葶也是不可能。朱成得知李時(shí)珍趕考便派人買通主考。 李時(shí)珍被考官誣陷舞弊，趕出場(chǎng)。李時(shí)珍心結(jié)積，一病不起。 萇葶暗中派人送與李時(shí)珍商量私，得不到任何回，失望之余病情重，也臥倒不起荊王急忙下令要言聞替女兒看診可是李時(shí)珍命在夕，李言聞根本法離開。危急時(shí)，斯語(yǔ)出面坦承己的藥膳是治療主的關(guān)鍵，立下死狀，進(jìn)入荊王救治萇葶。 成翊要求斯語(yǔ)留在自身邊，在王府享榮華富貴，被斯拒絕。 李時(shí)珍終于和斯語(yǔ)完婚，且跟隨父親正式始行醫(yī)。李時(shí)珍過(guò)幾輪考試，終進(jìn)入太醫(yī)院。 此時(shí)朱萇葶拜道士仲文為師，整日迷于煉丹食丹不自拔；而藍(lán)行義和已成為楊妃的雪英勾結(jié)，利用學(xué)醫(yī)術(shù)，在后宮風(fēng)作浪；朱成翊來(lái)到京城，和嚴(yán)蕃勾結(jié)一氣，貪無(wú)道；景王和裕爭(zhēng)奪太子之位，嵩和徐階兩派政斗爭(zhēng)激烈。李時(shí)卷入這波瀾詭譎謀重重的宮廷斗之中…… 李時(shí)珍發(fā)現(xiàn)萇葶體內(nèi)有中毒的跡象，于勸解萇葶暫停服，萇葶不聽，兩發(fā)生激烈爭(zhēng)執(zhí)。 李時(shí)珍向嘉靖進(jìn)，請(qǐng)求皇上別再食丹藥，嘉靖大，駁回他重修本的提議。嘉靖吃萇葶進(jìn)獻(xiàn)的長(zhǎng)生老丹藥，忽然病暈倒。嚴(yán)嵩父子機(jī)把責(zé)任推到李珍身上，將其下。 郡主查出其實(shí)始作俑者是朱成和嚴(yán)世蕃采辦回的假鹿茸。嚴(yán)世將朱成翊推到前成為替罪羊。嘉將朱成翊斬首，王痛失愛子。 李時(shí)珍終于進(jìn)入太院禁地查找武宗死的真正原因，發(fā)現(xiàn)武宗之死竟一個(gè)巨大的陰謀而且與嘉靖有關(guān)…李時(shí)珍為華南冤昭雪的想法成泡影。 郡主積毒已久，終于身亡李時(shí)珍心灰意冷萌生去意。他將部精力投入到修草上，希望從此們能辨別真?zhèn)危?間不再有假藥害。 李時(shí)珍回到蘄州，風(fēng)餐露宿，身試藥，為修本收集第一手資料 當(dāng)年的倭寇小藤以商人身份來(lái)找時(shí)珍拜師學(xué)醫(yī)。時(shí)珍見其誠(chéng)懇，留了他。小藤發(fā)《本草綱目》書，頓生賊心。他李時(shí)珍不備，偷書稿。斯語(yǔ)阻止藤，雖保住了書，但不幸被殺害李時(shí)珍悲痛欲絕 萬(wàn)歷十四年前后，《本草綱目》寫完成，王世貞應(yīng)為該書寫序。歷接到王世貞的疏，下令讓李時(shí)進(jìn)京獻(xiàn)書?？烧?李時(shí)珍準(zhǔn)備動(dòng)身際，蘄州附近開流行“天花”，時(shí)珍決定暫不進(jìn)，趕赴疫區(qū)為百治病。劇照?qǐng)D冊(cè)2(11張)在李時(shí)珍等人的努力下“天花”得到控?？衫顣r(shí)珍自己因過(guò)度勞累病倒。臨終時(shí)，李時(shí)囑咐建元將《本綱目》進(jìn)奉于朝福澤天下后世。幻覺中，李時(shí)珍佛看到《本草綱》被進(jìn)奉給皇上情景。 三年后，李建元將《本草目》進(jìn)獻(xiàn)給神宗 神宗派使者將《本草綱目》送往本、朝鮮等地，我中華文明福澤界?