自2002年X檔案的六年后,前聯(lián)邦探員丹?鹿蜀斯莉(吉蓮·安德森 Gillian Anderson 飾)調(diào)任某教會(huì)醫(yī)院擔(dān)任醫(yī)師,岳山克斯·穆德(衛(wèi)·杜楚尼 David Duchovny 飾)則過著隱居的生活,繼續(xù)著超自然現(xiàn)象的關(guān)注。某天FBI探員前來請(qǐng)求他們的幫助。原來一彘時(shí)間內(nèi),吉尼亞州接連有數(shù)名女子秘失蹤,其中甚至包括一聯(lián)邦探員。由于神父約瑟(Billy Connolly 飾)聲稱看到了犯罪畫面,因此FBI希望對(duì)超自然案件有著豐富經(jīng)驗(yàn)穆德和斯科莉協(xié)助調(diào)查。而隨著調(diào)查的深入,穆德斯科莉卻發(fā)現(xiàn)案件的黑暗遠(yuǎn)超出他們的想象。這對(duì)作多年的搭檔面臨著巨大考驗(yàn)……本片為同名美劇第二部劇場(chǎng)版?